Grotterne i Nerja ligger i Sydspanien i Sierra Almijara bjergene, nogle få kilometer fra byen Nerja, i Malaga provinsen. Kørselsvejledning finder man på Middelhavshovedvejen (35 minutter fra byen Malaga). De ligger perfekt i en malerisk natur omgivet af typiske Middelhavslandsbyer, fyldt med Andalusiens unikke skønhed. Der går også en bus til Nerja-grotterne.

Grotternes kalkstensformationer er dannet gennem de sidste 5 millioner år, dannet af en kæde af geologiske processer. I Triasperioden bundsatte betydelige mængder af kalkmudder sig på bunden af det ældgamle Middelhav, og blev senere omdannet til kalk-dolomit ahorn, som nu beskytter grotterne i Nerja.

Under bjerg-orogeny perioden (læren om bjergenes dannelse), som begyndte for 65 millioner siden, drev adskillige kalklag fra Afrika og Europa ned og dannede Beticas bjergene, som f.eks. Sierra Tejeda eller Almijara bjergene. Regnens overflod gennem de sidste 5 millioner år gjorde, at der dannede sig revner i ahornen, som stimulerede den videre nedbrydning. På denne måde, hvor undergrundsvandet cirkulerede, blev hulerne dannet. Senere på grund af den underjordiske strøm blev vandet tvunget til at finde vej til lavere lag. På denne måde begyndte hulerne at blive fyldt op med kalkkoraller. Gennem de sidste 800.000 år er de imponerende kalkstensfigurer blevet formet takket været den fortsatte kalklejring. Det er disse aflejringer, der har skabt det underjordiske sceneri i Nerja Grotterne, og det bør beundres.